Что делать,если мнение врача и фармацевта расходятся?

Если у вас есть сомнения по поводу назначенного лечения, то обязательно нужно обратиться к другому специалисту, чтобы подтвердить или опровергнуть назначенное лечение.
http://www.moscow-faq.ru/all_question/wayoflive/zdorove/2012/March/41012/126291

По поводу фармацевта - он конечно обладает информацией по лекарствам, но назначать лечение, все-таки должен лечащий врач.

Если есть сомнения по поводу назначенного лечения, то обязательно найдите возможность альтернативного диагноза, тем более, что это касается ребенка.